PCR實驗室
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一、概述:
PCR實驗室主要設在檢驗科和病理科,其特點是能將微量的DNA大幅增加,PCR是分子生物學研究和實驗的常規(guī)方法,應用于:艾滋病檢測、乙型肝炎、禽疫病、癌基因的檢測和診斷,動植物檢疫等,化妝品、食品衛(wèi)生檢測,轉基因作物與轉基因微生物檢測等。
PCR實驗室通常采用非單向流送風方式,所謂非單向流,指氣流流線方向不平行,風速也不一致。非單向流的氣流組織方式有上送下回式、上送下側回式、測送下回式、上送上回式、PCR實驗室一般采用上送下回式。上部送風依靠高效送風口進入房間,下部回風依靠每個房間的對稱分布的排風柱下部的排風口排風。
二、PCR實驗室平面布局
臨床基因擴增檢驗實驗室原則上分為四個單獨的工作區(qū)域:試劑貯存和準備區(qū)、標本制備區(qū)、擴增反應混合物配制和擴增區(qū)、擴增產物分析區(qū)。為避免交叉污染,進入各個工作區(qū)域必須嚴格遵循單一方向進行,即只能從試劑貯存和準備區(qū)→樣品制備區(qū)→擴增反應混合物配制和擴增區(qū)→擴增產物分析區(qū)。各實驗區(qū)之間的試劑及樣品傳遞應通過傳遞窗進行。
如何才能設計一個合格的PCR實驗室呢,簡單的說就是:各區(qū)獨立,注意風向,因地制宜,方便工作,同時也要注意標本的接收問題。
1.試劑貯存和準備區(qū):該實驗區(qū)主要進行的操作為貯存試劑的制備、試劑的分裝和主反應混合液的制備。試劑和用于標本制作的材料應直接運送至該區(qū),不得經(jīng)過其他區(qū)域。試劑原材料必須貯存在本區(qū)內,并在本區(qū)內制備成所需的貯存試劑。對氣流壓力的控制,本區(qū)并沒有嚴格的要求。
2.樣品制備區(qū):該區(qū)域主要進行的操作為臨床標本的保存、核酸(RNA、DNA)提取、貯存及其加入至擴增反應管和測定RNA時cDNA的合成。
本區(qū)的壓力梯度要求為:相對于鄰近區(qū)域為正壓,以避免從鄰近區(qū)進入本區(qū)的氣溶膠污染。另外,由于在操作中可能會發(fā)生氣溶膠所致的污染,所以應避免在本區(qū)內不必要的走動。
3.擴增反應混合物配制和擴增區(qū):該區(qū)域主要進行的操作為DNA或cDNA擴增。此外,已制備的DNA模板和合成的cDNA(來自樣本制備區(qū)) 的加入和主反應混合液(來自試劑貯存和制備區(qū)) 制備成反應混合液等也可在本區(qū)內進行。在巢式PCR測定中,通常在第一輪擴增后必須打開反應管,因此巢式擴增有較高的污染危險性,第二次加樣必須在本區(qū)內進行。
本區(qū)的壓力梯度要求為:相對于鄰近區(qū)域為負壓,以避免氣溶膠從本區(qū)漏出。為避免氣溶膠所致的污染,應盡量減少在本區(qū)內的不必要的走動。個別操作如加樣等應在超凈臺內進行。
4.擴增產物分析區(qū):該區(qū)域主要進行的操作為擴增片段的測定。如使用全自動封閉分析儀器檢測,此區(qū)域可不設。
本區(qū)是最主要的擴增產物污染來源,因此對本區(qū)的壓力梯度的要求為:相對于鄰近區(qū)域為負壓,以避免擴增產物從本區(qū)擴散至其它區(qū)域。
三、實驗室的設立標準可參照以下條例:
《實驗室生物安全通用要求》國家標準GB19489-2008
《臨床基因擴增檢驗實驗室工作規(guī)范》衛(wèi)醫(yī)發(fā)[2002]8號文
《臨床基因擴增檢驗實驗室管理暫行辦法》衛(wèi)醫(yī)發(fā)[2002]10號文
《臨床基因擴增檢驗實驗室設計標準》衛(wèi)醫(yī)發(fā)[2002]10號文附件
《基因檢驗實驗室技術要求》國家質監(jiān)檢驗總局SN/T1193-2003
《潔凈室及相關受控環(huán)境-生物污染控制》國際標準ISO14698
《潔凈廠房設計規(guī)范》國家標準GB500732013
《潔凈室施工及驗收規(guī)范》GB50591-2010
《室內空氣質量標準》國家標準GB/T18832002
《生物安全實驗室建筑技術規(guī)范》國家標準GB50346-2011《病原微生物實驗室生物安全管理條例》衛(wèi)生部(2004-11-12)
四、PCR實驗室建議:
沒有什么是一成不變的,要因地制宜,具體問題要具體分析。要分析具體的情況制定符合自己當前的需求,合乎國家的標準即可,不必強求理想狀態(tài)。
PCR實驗室的建立離不開以人為本,在做到防止污染的情況下,應最大限度地考慮在日常檢測工作時是否方便。實驗室的過道能否方便日后新設備的進出,人員工作服和工作鞋的換穿是否方便。
在實驗室裝修好后,按照實驗室的需求放置試驗臺,天平、冰箱、低溫冰箱、離心機、加樣器、振蕩器、紫外燈、冰箱、生物安全柜(或潔凈工作臺、或者排風柜排毒柜)、恒溫水浴、上下水設備、廢棄物容器、通風排風系統(tǒng)、水浴箱、Bioqure12全自動核酸提取儀、Micgene242/244實時熒光定量PCR儀等。
最后,歡迎各位定制PCR實驗室。我們擁有豐富的定制設計和建設經(jīng)驗。